Változások időszaka, 1938–1971

Nagy Kálmán lelkész távozásával nyugtalan időszak következik a gyülekezet életében. Megkezdődött a lelkészválasztással járó küzdelem, előbb három jelöltje is volt a híveknek, aztán amint változott a lelkészek sora, kitolódott a lelkészválasztás. 1940. április 2-án Jakab Sándor celldömölki segédlelkész kapott megbízatást a helyettes lelkészi szolgálatra. Alig indult el az új korszak, súlyos esemény rázta meg a híveket. Május 5-én, vasárnap az istentiszteleten a záróének alatt elnémult az orgona, és a kántor, Erdélyi Sándor összeesett, meghalt. Temetésén, május 7-én, Takács Elek esperes szolgálatával búcsúzott közel 4 éven át munkálkodó, szeretett fiatal tanítójától a gyülekezet.

Az előző választási harcok miatt a hívek elhanyagolták a lelkészlakás gondozását, a templom udvarát és körülvevő kertjét méteres gazerdő ölelte körül. A pártoskodások is szétszórták a híveket. Végül a presbitérium egy akarattal a helyettes lelkészt, Jakab Sándort hívta meg lelkésznek. Beiktatása 1940. aug. 18-án volt, Takács Elek esperesnek és a környező gyülekezetek lelkészeinek szolgálatával, részvételével. Igehirdetési alapigéje az új lelkésznek 1Kor 2,1–5 volt. Ugyanezen év aug. 4-én megválasztották a Gecsén lakó Hunyadi Zoltán tanítójelöltet.

A nőegylet tagjai nagy buzgalommal rendezték újjá a lelkészlakást, udvarát és a templomot körülölelő kertet, így várták az ifjú lelkészházaspárt, akik ez év október 17-én tartották esküvőjüket Győrött (a feleség Bándy Katalin tanítónő). A nőegylet munkálkodása felélesztette az ifjúságot is, bibliakörök alakultak, énekkart szervezett az ifjú tanító. Előadásokat tartottak nemcsak a gyülekezetben, de a szomszédos falvakban is. A bevételből új harmóniumot vásároltak 340 pengőért, valamint színpadi felszerelést, 50 db széket és az iskolába új padokat is. Vendégeket hívtak: Sopronból teológusokat, Pápáról hittanos gimnazistákat. Évente többször rendeztek szeretetvendégségeket, amelyeken KIE vezetők, Bonnyai Sándor lelkész, Popper Mária diakonissza, valamint szomszédos gyülekezetek lelkészei szolgáltak. 1942-ben a templom fűtését oldják meg kályhavétellel és tűzifa szerzésével. Június hónapban a templomtető teljes felújítását végeztetik el a hívek adakozásából.

Kitört a 2. világháború. A tanítót behívták 1942. okt. 4-én, így a lelkész felesége kapott megbízatást a gyerekek oktatására és a kántori teendők végzésére. Sűrűn jöttek a katonai behívók, az itthon maradottak hetenként többször imádkoztak békességért és az áldozatokért. A nőegylet 27 Bibliát osztott szét vagy küldött el a katonák után. Napközi otthont nyitottak, hogy munkálkodhassanak a nagyrészt megcsonkult családok. Volt olyan gazdaság, ahol a szerszámot a 15 éves ifjúnak kellett fognia édesanyja mellett. 1943-ban Szekeres Jolán lovászpatonai tanítónőt hívták a gyermekek oktatására, aki 2 éven át jó eredménnyel munkálkodott, még a kántori szolgálatba is besegített. Szeptember 10-én istentiszteleten búcsúztak az első hősi halottól: Kalmár Károlytól. Október 30-án a tanítás megszűnt, november 6-án pedig német katonákat szállásoltak be az iskolába. Az istentiszteletet, hitoktatást magánházaknál, olykor egy-egy udvarban tartották. A templom udvarán légvédelmi ágyú állt. Szerecsenyi bérházukba és az iskolába is menekülteket szállásoltak be.

1945 elején az általános mozgósítás elvitte a leventéket és a még itthon élő katonaköteles férfiakat. Menekült tanítók foglalkoztak a gyermekekkel és kántorizáltak. A húsvéti ünnepek alatt vonult végig a falun a front, riasztva az otthonok lakóit. A templom sértetlen maradt, csak a perselyt ürítették ki, és az iskolai villanyt semmisítették meg.

A háború utáni földbirtokrendezéskor a gecsei gyülekezet 5 kat. hold földet kapott, Szerecseny pedig templomépítés céljára telket. A hitélet is éledezett: a pápai hitoktatók vezette diákok műsoros estekkel, a helyi ifjúság pedig színielőadásokkal szolgáltak. Vasvári Dénes gondnok a lelkésszel együtt példásan munkálkodva vezették a híveket. Bár a pénz romlása megkezdődött, mégis sikeresen, önerőből – 10 698 Ft-ért – fizethették ki a felújítási munkát. Május 8-án ismét megnyílt a templom ajtaja Bácsi Sándor pápai lelkész szolgálatával.

Jakab Sándor lelkész 1971. december 31-én nyugalomba vonult megromlott egészségi állapotára való tekintettel. A hívek áldáskívánással búcsúztak tőle, és elkísérték győri otthonába. Feleségének is megköszönték kántori munkáját, az ifjúság és a nőegylet vezetését. 1985-ben búcsúzott el tőle volt gyülekezete a győr-nádorvárosi temetőben.